1990年，出演了电视剧处女作《Molloy》。1993年1月8日，与沃维克·戴维斯领衔主演的奇幻恐怖喜剧片《小妖精》上映。

1994年9月22日，与柯特妮·考克斯、丽莎·库卓等共同主演的情景喜剧《老友记第一季》首播，詹妮弗·安妮斯顿在剧中饰演未经世事的千金小姐“瑞秋·格林”  。

1995年9月21日，主演的情景喜剧《老友记第二季》开播  。1996年8月23日，与约翰·玛哈尼、莱斯利·曼恩等联袂主演的爱情喜剧片《爱是唯一》上映  ；9月16日，主演的情景喜剧《老友记第三季》播出  。

1997年4月17日，领衔主演的爱情喜剧片《纯属虚构》上映，她在片中饰演因迟迟没有结婚而被认为没有责任感，而无法找到称心如意工作的“凯特”  ；9月25日，主演的情景喜剧《老友记第四季》首播  。

1998年4月17日，与保罗·路德联合主演的爱情喜剧片《欲擒故纵》上映  ；9月24日，主演的情景喜剧《老友记第五季》开播  。

1999年2月19日，与朗·里维斯顿、斯蒂芬·鲁特合作出演的喜剧电影《上班一条虫》上映  ；8月6日，由布拉德·伯德执导的动画电影《钢铁巨人》上映，詹妮弗·安妮斯顿在片中为单身母亲“安妮·修斯”配音  ；9月23日，主演的情景喜剧《老友记第六季》播出  。

2000年10月12日，主演的情景喜剧《老友记第七季》首播  。2001年9月7日，与马克·沃尔伯格一同出演的音乐喜剧片《摇滚巨星》上映，她在片中扮演青春靓丽，对摇滚一窍不通的普通上班族“艾米莉”  ；9月27日，主演的情景喜剧《老友记第八季》开播  ，凭借该剧获得了第4届青少年选择奖最佳喜剧TV女演员奖  。

2002年8月25日，与杰克·吉伦哈尔、蒂姆·布雷克·尼尔森共同主演的喜剧电影《好女孩》上映  ，詹妮弗·安妮斯顿凭借该片获得了第5届青少年选择奖最佳剧情/动作冒险电影女演员奖  ，第6届好莱坞电影节最佳女主角奖  ；9月26日，主演的情景喜剧《老友记第九季》播出  ，凭借该剧获得了第5届青少年选择奖最佳喜剧TV女演员奖  ，第54届艾美奖喜剧类剧集最佳女主角奖  。

2003年5月23日，与金·凯瑞、摩根·弗里曼等联袂出演的奇幻爱情喜剧片《冒牌天神》上映  ；9月25日，主演的情景喜剧《老友记第十季》播出  ，凭借该剧获得了第6届青少年选择奖最佳喜剧TV女演员奖  。

2004年1月12日，与本·斯蒂勒领衔主演的爱情喜剧片《遇见波莉》上映，她在片中饰演女热衷于所有和冒险有关的事情的“波莉”  ；同年，美国《人物》杂志推出“全球最美丽的女人”排行榜，詹妮弗·安妮斯顿获得第一名  。

2005年11月11日，与克里夫·欧文、文森·卡索共同主演的惊悚电影《绝地威龙》上映，她在片中饰演金融投资顾问“露辛达”  ；12月22日，与凯文·科斯特纳、雪莉·麦克雷恩等联袂主演的爱情喜剧片《流言蜚语》上映，詹妮弗·安妮斯顿扮演外表迷人、清纯可人的讣告记者“萨拉·赫汀格”  。

2006年6月2日，与文斯·沃恩领衔主演的爱情喜剧片《分手男女》上映，她在片中饰演以经销艺术品为生的“布鲁克”  。

2007年8月7日，与Andrea Buchanan联合执导的短片《Room 10》上映，该片为其导演处女作，获得了第9届Cine Vegas电影节评审团最佳短片奖  ；同年，她与克里斯汀·汉恩（Kristin Hahn）合伙开办了回声影业（Echo Films）  。

2008年9月5日，与斯嘉丽·约翰逊、查理兹·塞隆等共同出演电视电影《抵抗癌症》上映；12月25日，与欧文·威尔逊领衔主演的家庭喜剧电影《马利和我》上映，她在片中饰演从女强人转型为家庭主妇的“珍妮·杰罗甘”，凭借该角色获得了第11届青少年选择奖最佳喜剧电影女演员提名  。

2009年2月6日，与本·阿弗莱克、斯嘉丽·约翰逊等共同主演的爱情喜剧片《他其实没那么喜欢你》上映  ；5月15日，担任制片人并主演的爱情喜剧片《操控》上映  ；9月18日，与亚伦·艾克哈特领衔主演的爱情电影《爱不胜防》上映，她在片中饰演深受极品花心男荼毒的花店女老板“埃勒维兹・钱德勒”  。

2010年3月19日，与杰拉德·巴特勒联袂主演的爱情喜剧片《赏金猎人》上映，她在片中扮演为了报道一个案子而受到诬陷变成重犯的记者“尼科尔·赫尔利”  ；9月22日，客串出演的喜剧《熟女镇第二季》首播  。

2011年2月11日，与亚当·桑德勒、布鲁克琳·黛克等合作出演的爱情喜剧片《随波逐流》上映  ，凭借该片获得了第21届MTV电影奖最佳女演员提名  ；7月8日，与杰森·贝特曼、凯文·史派西等联合主演的犯罪喜剧片《恶老板》上映，她在片中饰演有严重的色情狂倾向并且不分场合方式挑逗男下属牙医老板“茱莉亚·哈里斯”  ，凭借该角色获得了美国喜剧奖最佳女主角提名；10月10日，与派蒂·杰金斯、黛咪·摩尔等联合执导的喜剧电影《五》上映，詹妮弗·安妮斯顿凭借该片获得了第64届美国导演工会奖最佳电视电影或迷你剧集导演提名  。

2013年4月15日，担任制片人的剧情类电视电影《Call Me Crazy: A Five Film》首映；8月7日，与艾玛·罗伯茨、威尔·保尔特联袂主演的犯罪喜剧片《冒牌家庭》上映  ；9月14日，与与蒂姆·罗宾斯，艾拉·菲舍尔等合作出演的犯罪喜剧片《犯罪生活》在多伦多国际电影节闭幕式上首映  。

2014年8月29日，与伊莫琴·普茨、欧文·威尔逊等联合主演的喜剧电影《爱你就捧你》在第71届威尼斯国际电影节首映，她在片中饰演心理咨询师“简·克莱蒙特”  ；9月8日，担任制片人并领衔主演的剧情片《蛋糕》在多伦多国际电影节首映，她在片中饰演因毁容并患上慢性疼痛症而变得性情尖刻、自我放弃的“克莱尔”，凭借该角色获得了第72届美国电影电视金球奖电影类-剧情类最佳女主角提名  ；11月26日，与杰森·贝特曼、查理·戴等共同主演的喜剧电影《恶老板2》上映  。

2015年8月12日，参与配音旁白的环保纪录片《万物一体》在北美公映  ；8月20日，《福布斯》杂志8月20日公布“全球最高薪女星排行榜”，詹妮弗·安妮斯顿以年收入1650万美元排名第5  。

2016年4月21日，詹妮弗·安妮斯顿获得了美国《人物》杂志“全球最美丽的女人”排行榜第一名  ；4月29日，与朱莉娅·罗伯茨、凯特·哈德森等联袂出演的喜剧电影《母亲节》上映  ；8月，《福布斯》杂志公布了年度全球女演员富豪榜，詹妮弗·安妮斯顿以2100万美元年收入排名第4  。

2017年1月21日，与阿尔登·埃伦瑞奇、泰尔·谢里丹合作出演的战争电影《黄鸟》在圣丹斯电影节上映  。2018年12月7日，与德芙·卡梅隆、卢克·本沃德等联合出演的音乐喜剧片《饺子公主》上映  。

2019年6月14日，与亚当·桑德勒领衔主演的Netflix喜剧电影《谋杀疑云》在Netflix的流媒体上映  ；8月，《福布斯》杂志公布了年度全球女演员富豪榜，詹妮弗·安妮斯顿以2800万美元年收入排名第5  ；11月1日，与瑞茜·威瑟斯彭、史蒂夫·卡瑞尔等共同主演的电视剧《早间新闻第一季》首播，凭借该剧获得了第26届美国演员工会奖电视类剧情类剧集最佳女主角奖  。