21世纪初，人类将多数人留在被(bèi )哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的(🔧)人们乘上恒星间移(🍖)民船·阿拉特拉姆，前往能够移居的“约定之地·τ星eccc。但这一(🎡)计划失败，人类只(🥄)得再度返回地球。而长距离亚空间航行所引发的时空(kōng )歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后(hòu )的地球”。在这个地球，主(💻)人公·晴男等人在遭(🤠)受哥斯拉袭击的同时，与埃(āi )克西弗(🥫)、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过(guò )殊死战斗成功击倒了哥斯拉。但喜悦(yuè )并未持(chí )续多久，深藏地下的真(🔈)正(zhèng )哥斯拉“哥斯拉·地球”现身了(👌)。两万年间持续(xù )成长生存、(🔞)身高300米、质量(liàng )超过(🖍)10万吨，在进化成这种(zhǒng )姿态的超巨大哥斯拉压倒(dǎo )性的破坏力面前，晴男等人落花流(🚤)水。拯救了晴男的是被视为(wéi )人类的残存(cún )者“弗图亚”之民，米亚娜(nà )。弗图亚是他们在(🕵)这个(gè )地球(🐇)首次遇到(🏗)的人型生命(mìng )种族。他们(🍝)会是人类的子孙吗——。“弗(fú )图亚的神(🍗)也被哥(gē )(🐑)斯拉击破，如今只剩(🥈)下卵。挑战者、抗争者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这样的他们，晴男回应道“这是以人类的双(📒)手夺回地球的最后机会了”。另一方面，比尔沙尔德的指挥官·加尔格，注意到(👉)弗图亚(🚞)使用的箭头是由“自律思考金属体·纳米金属(shǔ )”所制造而欢喜。这(😍)和21世纪他们在富士山麓作为“对哥斯拉决战兵器”所开发、在启动前遭到破坏的(de )(⚡)“机械哥斯拉”由同种物质所构成。这正(zhèng )(🏃)是当时的开发设备至今仍然残存(🧗)的证明(míng )——。