2285年，在与(yǔ )可汗的战斗中损(sǔn )坏的联邦星舰进取号，返回(huí )了地球的太空港以进行维ddd。柯克还在为斯波克的死感到悲伤。麦科伊医生出现了种种异常的行为(🕖)：如擅自闯入被封锁的斯波克原来的舱房、胡言乱语等，最后他被送(🕕)进(🤯)了医院进行精神检(jiǎn )查。斯科提被另分派到了联邦星舰精进号。星际舰队指挥部对新(✋)形成(🏂)的创世星(🌞)下达了禁入令。柯(🎾)克被告知，进取号即将(🚻)除役。斯波克的父亲沙瑞克找到柯克并告诉他，斯波克的遗体必须返回瓦肯星(💍)，否则他的(de )灵魂就不得安息。沙瑞克(kè )要求柯克必(📟)须回到创世星，寻回斯波克的遗棺并将它带回瓦肯星——(♌)而斯波克临死前与麦科伊(🌂)进行(🌱)了心灵融(róng )(🖍)合，因此带(dài )有斯波克灵魂的麦科伊也必须前往瓦肯星。可是，星际(🤼)舰队拒绝让陈旧(😉)的进取号离(lí )开太空港。从医院出来后听(🔍)闻消息的麦科伊，企图招募一艘飞船回到创世星。在与人(rén )争吵时他被逮捕，但这并没有影响到整个计划：在柯克、斯科特、苏(sū )鲁、乌乎拉和切科夫的(de )帮助下麦科伊顺利逃脱，并一同登(dēng )上了被废弃的进取号。为了避免(miǎn )被追击，斯科提还破坏了精进号(🤙)的引擎。六(🤫)名伙伴冒着毁(🌄)掉毕生事业的风险，驾驶(💦)进取号航向创世星。其间，克林贡人得知了创世计划和创世星的消息。由于担心联邦将其改造为一种新式武器，克(🏥)鲁格船长率领一艘克林(lín )贡猛禽战舰，去夺取或摧毁这一战略性的武(wǔ )器。在联邦星舰葛瑞森(sēn )号上，戴(dài )维·马库斯博士与莎维可(🏃)上尉在创世(shì )星的轨道上进行着科学(xué )观(⤴)测。他们很(hěn )快便在地(🔝)面上发现了生命形式，出于好奇心的驱使，他们俩传送上了星(xīng )球表面并发现了斯波克空(kōng )荡的遗棺。循着生命形式的读数，他们发现(💁)了幼年斯(sī )(🈴)波克的活体：成长速度(📐)奇(🥂)快，但却没有意识或灵魂。克林贡(🧤)人在此时(shí )也抵达了创(🕰)世星，他们摧毁了葛瑞森号并抓获莎(🐂)维可(📰)、马库斯和少年的斯波克作(🛹)为人质。不一会(huì )，进取号也抵(🐻)达(🈷)穆塔拉星区（MutaraSector），很快就被克鲁格与他的一群克林(🚱)贡战士攻击到瘫痪。由于克林贡人威胁将夺去人质的生命，柯(🤱)克使用了一个计谋来重新掌控(kòng )局势，但并未成功。戴维·马库斯随后被克林(lín )贡人杀害。由于没有其他(tā )的选(xuǎn )择，柯克只得向克林(lín )贡人投降。柯克为了重新占据上风，冒死一(yī )搏(😾)启动(dòng )了进(🌭)取号的自毁程序。进(🔙)取号的船员(yuán )随后传送上了创世星，目睹着(🌓)进(🌂)取号在一片亮光中毁灭，同(tóng )时也捎带上了克(kè )鲁格大部分的战士(shì )。柯克最终与(yǔ )他的团队从克林贡人(rén )手中营救了斯(sī )波克与莎维可，并在与克鲁格的一对一战斗中杀死了他。由于创世(👊)星独特的力量(🅰)，斯波克的遗体(🍩)得以重生(🏾)，并随着创世星衰老的速度迅速地成长。在离开不稳定的(de )创世(📊)星时(shí )，斯波克刚好达到(dào )死亡前的年(nián )龄。在登上(shàng )夺来的猛禽舰时，创世星开始了剧烈的爆炸。在沙瑞克的庇护下，猛禽舰抵达了瓦肯星(xīng )。在(zài )经历了危险的“浮图邦术”仪式后，斯(sī )波克的(😯)灵魂离开了(🏁)麦科伊(yī )的意识回到了自己(jǐ )的身体中。仪(yí )式最终成功，复活的斯波克开始重新(xīn )回忆他的(de )过去与朋(péng )友。他问进取号的船(chuán )员(yuán )们，为(🚁)什么要冒着失去生命与毁掉事业的危险营救他(🎼)；(⛲)柯克(🍓)告(🧐)诉(sù )他，有些(xiē )时候需要“牺牲大我，成(chéng )全小我”。